achdem die vorherige Kirche und ihre Nebengebäude am 21. April 1779 bei einem großen Dorfbrand vollständig zerstört wurden, legte man im Jahre 1789, im Friedhofsgelände auf einer Anhöhe den Grundstein für das jetzige Kirchengebäude.
Die neue Kirche wurde am 13. November 1793 eingeweiht.
1821 wurde ein Turm angebaut und nach und nach kamen Glocken hinzu, die seit 1883 ein vierstimmiges Geläut bilden.
In den Wirren der beiden Weltkriege mussten die Glocken abgegeben werden, wurden aber 1949 in dem 46 Meter hohen Turm erneuert.
eute läutet täglich eine von den Kriegen verschont gebliebene Gebetsglocke.
Zur Innenausstattung gehört eine Orgel von Orgelbaumeister Caspar Holland aus Schmiedefeld, welche 1797 eingeweiht wurde. Ebenso Buntglasfenster und ein Altar, der zum Teil aus Crottendorfer Marmor besteht.
Seit 2011 wird eine umfassende Sanierung der St.-Johannis-Kirche in Niederzwönitz durchgeführt.
er Bibelspruch: „Seid Täter des Wortes und nicht Hörer allein.” an der Kanzel der Kirche soll uns leiten und begleiten….